Program Studi Doktor Pemuliaan dan Bioteknologi Tanaman Sebagai pusat unggulan (center of excellence) bertaraf internasional dalam pengembangan sumber daya manusia yang mampu mengembangkan ilmu pengetahuan dan atau teknologi baru dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika dengan dukungan kurikulum yang membekali pencapaian intelektualitas unggul, membangun kompetensi abad 21, serta memfasilitasi ekosistem tumbuh kembang diri melalui penyediaan suasana akademik yang kondusif.
Sebagai pusat unggulan (center of excellence) bertaraf internasional dalam pengembangan sumber daya manusia yang mampu mengembangkan ilmu pengetahuan dan atau teknologi baru dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika melalui pendekatan inter, multi, atau transdisipliner dalam rangka mendukung kedaulatan pangan dan bioenergi, serta kelestarian lingkungan, menempatkan diri sebagai pemimpin dalam menghadapi tantangan global di bidang pertanian dan bioteknologi..
1. Menyelenggarakan program pendidikan Doktor di bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika yang bermutu dan berdaya saing serta diakui secara nasional dan internasional.
2. Melaksanakan penelitian dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika yang bermanfaat bagi ilmu pengetahuan dan kemaslahatan umat manusia, serta mampu mendapatkan pengakuan nasional dan internasional.
3. Melaksanakan pengabdian kepada masyarakat dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika melalui diseminasi IPTEK dan varietas unggul untuk mendukung kedaulatan pangan dan bioenergi, serta kelestarian lingkungan.
Aspek Sikap:
CPL-01.Menunjukkan integritas, profesionalitas, tanggung jawab, dan sikap kolaboratif dalam kegiatan akademik, penelitian, dan pekerjaan di bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman secara inter, multi dan transdisipliner.
CPL-02 Menghargai nilai-nilai etika ilmiah serta kepedulian terhadap pelestarian lingkungan dan keanekaragaman hayati.
Aspek Pengetahuan:
CPL-03
Menguasai dengan mendalam konsep teoritis dan implementasinya untuk menyelesaikan masalah dalam pengelolaan sumber daya genetik dan pengembangan varietas unggul melalui pendekatan konvensional dan atau berbasis bioteknologi.
CPL-04.Memahami dengan mendalam regulasi dan kebijakan terkait pemuliaan dan bioteknologi tanaman, serta pengelolaan sumber daya genetik dan penggunaannya dalam bidang akademik maupun industri.
Aspek Keterampilan Umum
CPL-05.Mampu merancang, mengelola, dan mengevaluasi program penelitian melalui pendekatan inovatif dengan mengintegrasikan teknologi informasi dan metode analisis data modern dalam penyelesaian masalah untuk menghasilkan solusi implementatif di bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman.
CPL-06. Mampu menyampaikan ide dan temuan riset pada berbagai media diseminasi serta menyampaikan rekomendasi secara efektif kepada berbagai pemangku kepentingan, dalam lingkup nasional dan internasional.
Aspek Keterampilan Khusus:
CPL-07 Mampu merancang pemanfaatan dan penerapan secara inovatif teknik biologi seluler dan molekuler untuk mendukung kegiatan pemuliaan dan bioteknologi tanaman.
CPL-08 Mampu menganalisis data pemuliaan dan bioteknologi tanaman menggunakan pendekatan biometrika dan bioinformatika.
CPL-09. Mampu menyusun peta jalan penelitian dan mengembangkan varietas tanaman dengan pendekatan konvensional dan atau berbasis bioteknologi
Menjadi penyelenggara untuk program pendidikan Doktor di bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika yang bermutu dan berdaya saing serta diakui secara nasional dan internasional; melaksanakan penelitian dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika yang bermanfaat bagi ilmu pengetahuan dan kemaslahatan umat manusia, serta mampu mendapatkan pengakuan nasional dan internasional, dan melaksanakan pengabdian kepada masyarakat dalam bidang pemuliaan dan bioteknologi tanaman tropika melalui diseminasi IPTEK dan varietas unggul untuk mendukung kedaulatan pangan dan bioenergi, serta kelestarian lingkungan.
Program Studi Doktor Pemuliaan dan Bioteknologi Tanaman memiliki keunggulan sebagai berikut:
1. Kurikulum yang lengkap
2. Sumber daya manusia (dosen) yang kompeten dan tenaga kependidikan yang terampil dan melayani sepenuh hati.
3. Akademik atmosfir yang kondusif
4. Kerjasama internasional yang aktif memberi kesempatan mahasiswa untuk magang, riset di universitas/institusi riset bereputasi di luar negeri.
5. Dana penelitian yang memadai karena dosen-dosen yang aktif mengajukan dana penelitian dan meneliti
6. Unit penyelenggara (Departemen Agronomi dan Hortikultura) memiliki Jurnal Ilmiah (Jurnal Agronomi Indonesia, Jurnal Hortikultura Indonesia, terindeks SINTA) dan Journal Tropical Crop Science (terindeks Scopus) yang dapat memfasilitasi publikasi hasil riset mahasiswa dan dosen.
Doktor Lulusan PS Pemuliaan dan Bioteknologi Tanaman dapat bekerja sebagai Peneliti, Dosen, Konsultan Program Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Tanaman, Pimpinan Program Pemuliaan Tanaman dan Bioteknologi Tanaman
Mata kuliah ini membahas perkembangan terkini tentang potensi pemanfaatan bioteknologi modern dalam pemuliaan tanaman. Dalam perkuliaahan akan dibahas berbagai topik terkini mencakup pemahaman mengenai impact dari bioteknologi tanaman dalam program pemuliaan dan pertanian, organisasi genom tumbuhan dan regulasi ekspresi gen, DNA rekombinan, desain dan konstruksi vektor, regenerasi in vitro dalam pemuliaan tanaman, teknologi haploid dalam pemuliaan tanaman, fusi protoplast, rekayasa genetika dalam pemuliaan tanaman, marka molekuler, gene tagging dan gene discovery, genomic selection breeding, genome editing, serta regulasi, biosafety, dan komersialisasi produk rekayasa genetika. Materi praktikum diberikan dalam praktikum laboratorium, demo, simulasi dan kunjungan.
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa agar mampu merencanakan penelitian pemuliaan multidisiplin secara komprehensif; mendesain dan menggunakan beberapa metode penting dalam lingkup seleksi, respon terhadap seleksi sampai kepada analisis stabilitas galur-galur harapan yang diperoleh; menganalisis perilaku data dan ragam serta partisi dari komponen ragam dalam penelitian pemuliaan tanaman.
Mata kuliah ini menjelaskan pendekatan pemuliaan tanaman untuk produksi tanaman di lingkungan bercekaman biotik dan abiotik, membahas bentuk cekaman biotik dan abiotik serta mekanisme resistensi terhadap cekaman biotik dan toleransi terhadap cekaman abiotik. Kuliah ini juga membahas pendekatan konvensional maupun bioteknologi untuk meningkat kemajuan genetik pada pemuliaan di lingkungan
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa untuk mampu menganalisis berbagai struktur, jumlah, fungsi dan perilaku kromosom dalam kaitannya dengan keragaman genetik tanaman, sehingga mampu merekayasa struktur, jumlah dan fungsi kromosom untuk kepentingan perbaikan genetik tanaman; mahasiswa juga mampu melacak asal usul genom suatu tanaman dengan mempelajari hubungan sistematik antara tanaman dengan kerabatnya.
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa agar mampu menjelaskan arti dan ruang lingkup tentang bioteknologi tanaman pada tingkat selular dan molekular serta aplikasinya dibidang pertanian, serta mahasiswa mampu menerapkan salah satu teknik dibidang bioteknologi tanaman. Pokok bahasan meliputi ruang lingkup bioteknologi tanaman dan manfaatnya dalam pertanian secara umum, peranan teknik kultur jaringan dalam perbanyakan dan perbaikan sifat tanaman, hibridisasi somatik, merakit varietas dihaploid dengan kultur anthera, in vitro flowering untuk in vitro fertilisasi, memproduksi senyawa metabolit sekunder ,seleksi mutan dan variasi somaklonal dengan teknik molekular, identifikasi dan estimasi variasi genetik tanaman dengan teknik molekular, marka molekular dalam pemuliaan, isolasi gen, rekayasa genetika tanaman dan ekspresi gen, konsep keamanan hayati, regulasi dan paten produk bioteknologi molekular, penerapan bioteknologi pada tanaman pangan, perkebunan dan hortikultura, serta penerapan teknologi molecular farming dalam pertanian moderen. Dalam praktikum mahasiswa diarahkan untuk memperoleh pengalaman penerapan teknik-teknik selular hingga molekular dalam bioteknologi tanaman.
Mata kuliah ini membahas biosintesis, cara kerja hormon, transduksi sinyal, dan fungsi hormon. Penggunaan dalam bidang pertanian (pembiakan tanaman, produksi tanaman, pemuliaan tanaman dan lain-lain) akan dibahas. Jenis hormon yang dibahas ialah auksin, giberelin, sitokinin, etilen, asam absisat, poliamin, asam jasmonat, retardan, brasinosteroid dan peptida kecil.
Mata kuliah ini membahas teori dan praktek penggunaan teknik seluler dalam hubungannya dengan bioteknologi pertanian. Prinsip-prinsip dasar kultur jaringan akan diperkenalkan dalam kegiatan perkuliahan. Jalur-jalur regenerasi termasuk induksi embrio somatik sebagai dasar untuk implementasi teknik seluler dalam pemuliaan tanaman menggunakan pendekatan in vitro. Pemakaian teknik seluler untuk mendukung pemuliaan tanaman dengan menggunakan pendekatan in vitro yang dipelajari meliputi induksi variasi somaklonal dan induced mutation dengan dukungan teknologi in vitro. Seleksi pada lingkungan tercekam biotik dan abiotik, kultur, fusi dan regenerasi protoplas, kultur mikrospora untuk mendapatkan tanaman haploid, produksi metabolit sekunder, penyelamatan embrio, pelestarian plasmanutfah dan eliminasi penyakit sistemik secara in vitro juga akan dibahas dalam perkuliahan. Penguasaan materi oleh mahasiswa diuji melalui kegiatan diskusi kelompok, test pilihan ganda dan test essay. Kegiatan praktikum diarahkan untuk penguasaan teknik untuk beberapa topik yang didiskusikan dalam perkuliahan, dan diarahkan untuk menambah wawasan dan pendalaman pengetahuan mahasiswa.
Mata kuliah ini membahas tentang perancangan program pemuliaan tanaman yang didasarkan pada tujuan dan metode pemuliaan tanaman pada setiap kelompok reproduksi tanaman yaitu menyerbuk sendiri, menyerbuk silang dan membiak vegetatif. Berbagai metode pemuliaan tanaman akan dipelajari lebih mendalam, khususnya modifikasi metode untuk meningkatkan presisi dan efisiensi program pemuliaan. Rancangan diagram alur dan peta jalan (roadmap) pemuliaan tanaman menjadi salah satu luaran dari mata kuliah ini.
Mata kuliah ini membahas mengenai penerapan omics dalam pemuliaan tanaman. Materi yang diberikan mencakup deteksi dan metode aksi karakter tanaman secara lebih presisi mulai dari pendekatan genomic, proteomic, metabolomic, phenomic, serta bioinformatika dengan prinsip dasar genetika dan latar belakang yang diperlukan dalam program pemuliaan tanaman. Materi praktikum diberikan dalam praktikum laboratorium, demo, simulasi dan kunjungan.
Mata kuliah mengembangkan pengetahuan dan kemampuan mahasiswa dalam menggunakan Bahasa Inggris untuk ketrampilan menulis dalam context akademik.
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa untuk mampu menjelaskan organisasi pemuliaan tanaman, keragaman genetik dan pengelolaannya, sistem pembiakan tanaman kaitannya dengan pemuliaan tanaman, kontrol persilangan dan pengendalian seks, pewarisan sifat kuantitatif, penentuan metode dan prosedur pemuliaan tanaman, berbagai metode pemuliaan dan seleksi pada tanaman menyerbuk sendiri dan menyerbuk silang, depresi silang dalam, heterosis, dan metode pembentukan hibrida, metode pemuliaan tanaman yang berbiak secara vegetatif, serta prosedur pelepasan varietas dan UU PVT.
Mata kuliah ini membahas teori dan praktek penggunaan teknik seluler dalam hubungannya dengan bioteknologi pertanian. Prinsip-prinsip dasar kultur jaringan akan diperkenalkan dalam kegiatan perkuliahan. Jalur-jalur regenerasi termasuk induksi embrio somatik sebagai dasar untuk implementasi teknik seluler dalam pemuliaan tanaman menggunakan pendekatan in vitro. Pemakaian teknik seluler untuk mendukung pemuliaan tanaman dengan menggunakan pendekatan in vitro yang dipelajari meliputi induksi variasi somaklonal dan induced mutation dengan dukungan teknologi in vitro. Seleksi pada lingkungan tercekam biotik dan abiotik, kultur, fusi dan regenerasi protoplas, kultur mikrospora untuk mendapatkan tanaman haploid, produksi metabolit sekunder, penyelamatan embrio, pelestarian plasmanutfah dan eliminasi penyakit sistemik secara in vitro juga akan dibahas dalam perkuliahan. Penguasaan materi oleh mahasiswa diuji melalui kegiatan diskusi kelompok, test pilihan ganda dan test essay. Kegiatan praktikum diarahkan untuk penguasaan teknik untuk beberapa topik yang didiskusikan dalam perkuliahan, dan diarahkan untuk menambah wawasan dan pendalaman pengetahuan mahasiswa.
Mata kuliah ini membahas pentingnya metode penelitian yang runut, terstruktur dan di disain dengan pendekatan komprehensif agar dapat menghasilkan publikasi ilmiah yang dapat diterbitkan dalam jurnal ilmiah internasional bereputasi. Selain itu, dalam perkuliahan juga dibahas strateji penyiapan manuskrip yang berpotensi mampu lolos dari proses peer review dan dapat terbit di jurnal ilmiah internasional. Komunikasi hasil penelitian merupakan tindak lanjut dari kegiatan penelitian yang harus dilakukan oleh mahasiswa pascasarjana. Penelitian tidak dikatakan selesai sebelum dilakukan komunikasi hasil penelitian melalui berbagai media publikasi (presentasi riset dan penulisan jurnal ilmiah). Dalam mata kuliah juga membahas tip dan trik teknik presentasi hasil-hasil penelitian, penyusunan presentasi dalam bentuk poster dan presentasi oral, penyiapan hasil-hasil penelitian dalam bentuk publikasi ilmiah nasional dan intenasional. Sosialisasi tentang pemahaman etika dalam publikasi ilmiah juga akan dibahas dalam perkuliahan. Penekanan kegiatan akan dilakukan lebih banyak dalam bentuk praktek (60%) dan dalam bentuk perkuliahan (40%). Secara berkala, dosen tamu yang berkompeten terkait dengan metodologi penelitian dan publikasi ilmiah akan dihadirkan selama periode perkuliahan.
Kuliah ini membahas penerapan prinsip-prinsip genetika populasi dengan menjadikan sifat metrik, bukan sifat kualitatif, sebagai lingkupannya didahului pertelaan mengenai “Populasi” perihal frekuensi gen, frekuensi genotipe serta kajian hukum keseimbangan Hardy-Weinberg serta bahasan mengenai faktor-faktor sistematik dan dispersif pengubah frekuensi gen. Penelaahan ditekankan terhadap sifat dengan variasi-kontinyu / sifat kompleks. Pengertian dasar mengenai : nilai tengah populasi, nilai rata-rata substitusi gen, nilai pemuliaan, nilai aditif, nilai deviasi dominan dan nilai interaksi antar gen serta hal-hal yang bertalian dengan ragam/peragam genetik total serta komponen-komponen ragam/peragam merupakan fokus kuliah ini. Diskusi mengenai heritabilitas, korelasi genetik, tangkar-dalam, respon seleksi, respon terkorelasi, pengelolaan karakter ambang serta analisis QTL juga akan mengisi kuliah ini.
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa tentang arti penting/ peranan mutasi dalam meningkatkan keragaman dan perbaikan sifat tanaman, membahas berbagai teknik pemuliaan mutasi dan dasar-dasar manipulasi genetik pada pemuliaan mutasi, serta membahas berbagai informasi mutakhir tentang pemuliaan mutasi pada tanaman
Mata kuliah ini membahas teori dan praktek penggunaan teknik rekayasa genetika tanaman dalam hubungannya dengan bioteknologi pertanian. Prinsip dan dasar rekayasa genetika tanaman akan diperkenalkan dalam kegiatan perkuliahan. Pemakaian rekayasa genetika alami (Agrobacterium tumefaciens), teknik transfer gen menggunakan gene gun (particle bombardment), dan teknik yang lain untuk menghasilkan tanaman transgenik akan didiskusikan. Dalam kuliah dibicarakan pengenalan berbagai macam vektor plasmid dan gen marker yang dipakai dalam rekayasa genetika serta pemanfaatan Rekayasa genetikan untuk mengatasi berbagai macam permasalahan di bidang pertanian, seperti : tanaman tahan herbisida, tahan hama, tahan penyakit cendawan, bakteri dan virus, tanaman dengan mutu biji dan mutu buah yang lebih baik, serta penggunaan rekayasa genetika dalam molecular farming maupun berbagai studi mendasar pada genetika tanaman akan didiskusikan. Kegiatan praktikum di laboratorium dan diskusi kelompok untuk pendalaman berbagai topik perkuliahan juga merupakan bagian dari kuliah ini.
Kuliah ini membahas secara konprehensif mengenai fenomena biologis dan fisiologis sel tanaman dalah hubungannya dengan bioteknologi pertanian dan untuk mendukung pemuliaan tanaman. Materi yang dibahas meliputi struktur dan fungsi berbagai organel sel (terutama nukleus, mitokondria, kloroplas, vakuola), siklus pembelahan dan perbanyakan sel, proliferasi dan deferensiasi sel, peran dan fungsi sel sebagai bagian jaringan, teori evolusi sel, struktur dan fungsi membran, sito-skeleton, transduksi signal di dalam dan antar sel tanaman, mekanisme dan proses interaksi sel tanaman dan mikroba, mekanisme dan proses respon sel serta jaringan terhadap cekaman abiotik. Dalam kuliah juga dibahas secara mendalam keterkaitan berbagai topik perkuliahan dalam hubungannya dengan produksi tanaman, bioteknologi dan pemuliaan tanaman. Diskusi berbagai isu terkini terkait biologi dan fisiologi terkini akan dilakukan menggunakan berbagai publikasi ilmiah terkini yang relevan dengan topik perkuliahan untuk pendalaman dan peningkatan pemahaman mahasiswa tentang topik-topik terkait.
PBT1636 - Teknik Laboratorium dalam Bioteknologi Tanaman
Deskripsi :
Mata kuliah ini memberikan pemahaman mengenai teknik-teknik laboratorium dalam bioteknologi molekuler tanaman, yang meliputi fasilitas laboratorium dan laboratory safety; teknik isolasi, purifikasi dan kuantifikasi materi genetik (DNA/ RNA) tanaman; teknik elektroforasi dan visualisasi DNA/ RNA; teknik mendesain primer dan PCR (polymerase chain reaction); teknik hibridisasi dan desain probe. Rangkaian teknik isolasi (cloning) gen, perunutan basa nukleotida (sequencing), konstruksi plasmid, hingga teknik transformasi gen untuk rekayasa genetika juga akan dibahas. State of the art mengenai teknik laboratorium dalam bioteknologi tanaman akan dibahas sesuai dengan perkembangan ilmu dan kehadiran dosen tamu. Praktikum akan dirancang dalam bentuk pratek laboratorium, simulasi dan diskusi paper
Mata kuliah ini membahas tentang pengelolaan sumber daya genetik (SDG) tanaman untuk pemanfaatan yang berkelanjutan dalam bidang pertanian. Dalam kuliah ini akan dibahas mengenai pengertian center of origin, center of diversity, hak atas SDG, eksplorasi, koleksi dan dokumentasi SDG, konservasi in situ dan eks situ, karakterisasi untuk utilisasi, pemanfaatan SDG untuk perbaikan genetik tanaman, pertukaran SDG dan MTA, serta regulasi nasional dan internasional tentang SDG dan komersialisasi SDG.
Mata kuliah ini untuk memperkaya materi penelitian disertasi mahasiswa untuk mempercepat kelulusan. Mata kuliah ini untuk memperkaya materi penelitian disertasi melalui studi literatur atau penyusunan roadmap / bagar alir / metode penelitian, atau penyusunan proposal penelitian, untuk mempercepat kelulusan.
Mata kuliah Regulasi Pertumbuhan dan Perkembangan Tanaman membahas: struktur dan fungsi meristem, siklus sel, pembesaran, pendewasaan dan diferensiasi sel; induksi dan diferensiasi bunga, buah dan biji; transduksi sinyal dalam regulasi pertumbuhan dan perkembangan tanaman. Pembahasan mencakup aspek hormonal, seluler dan molekuler.
Mata kuliah ini merupakan tahap awal untuk mengevaluasi kelayakan mahasiswa sebagai calon doktor melalui ujian tertulis mengenai pengetahuan secara komprehensif terhadap penelitian yang akan dilakukannya.
Mata kuliah ini merupakan tahap lanjutan untuk mengevaluasi kelayakan mahasiswa sebagai calon doktor melalui ujian lisan mengenai pengetahuan secara komprehensif terhadap penelitian yang akan dilakukannya.
Mata kuliah ini adalah penyusunan naskah dan pemaparan rencana penelitian disertasi dalam seminar.
Mata kuliah ini adalah penyusunan rencana penelitian secara tertulis sebagai persiapan dalam pelaksanaan penelitian program doktor.
Mata kuliah ini memberikan pengetahuan kepada mahasiswa untuk mampu menjelaskan secara baik filosofi, kebijakan, strategi dan teknik pemuliaan tanaman dalam kaitannya dengan pembangunan pertanian berkelanjutan, prinsip-prinsip pelestarian fungsi lingkungan dalam pengelolaan sumberdaya genetik, mereview keunggulan dan kelemahan berbagai metode pemuliaan tanaman (persilangan dan seleksi) baik konvensional maupun nonkonvensional, merancang program pemuliaan secara konfrehensif, efektif, efisien dan ramah lingkungan, prinsip pemuliaan berbasis partisipasi masyarakat dengan memanfaatkan keunggulan sumberdaya genetik dan kearifan masyarakat lokal.
Mata kuliah ini merupakan pengayaan dan pendalaman (in-depth study) topik-topik terkini terkait implementasi bioteknologi tanaman dalam program dan atau penelitian pemuliaan tanaman. Dalam mata kuliah ini akan dilakukan pembahasan terhadap disain penelitian, metodologi dan implementasinya di lab maupun di lapangan, review literatur terkini, analisis data dan aspek-aspek relevan lainnya. Topik yang dibahas bervariasi sesuai dengan perkembangan penelitian terkini di bidang yang relevan dengan topik perkuliahan.
-