Pemahaman konsep sumberdaya perairan sebagai media, ekosistem dan pemanfaatannya; analisis dan diagnosis dinamika perairan, kelayakan dan optimalisasi pendayagunaan berdasarkan daya dukung, perencanaan strategis pengelolaan sumberdaya perairan dan kelembagaannya.

 Identifikasi sumberdaya perikanan dan pemanfaatannya. Konsep pemanfaatan dan tingkat exploitasi terhadap populasi (daur hidup, umur, ukuran pertama kali memijah, peremajaan dan yield/recruit) di berbagai tipe ekosistem sebagai dasar bagi pemenfaatan, pengendalian dan pengaturan untuk optimasi pemanfaatan sumberdaya ikan.

Konsep, gejala, sebab-akibat, mekanisme. implikasi ekologis, strategi pengendalian, dan pengelolaan eutrofikasi di berbagai ekosistem perairan

Pengertian habitat ikan, biologi ikan (makanan, pertumbuhan, reproduksi, daur hidup), ekologi ikan (distribusi, migrasi), aplikasi pada perikanan dan kelautan

Mata kuliah ini memaparkan hidupan awal biota akuatik (ikan, krustasea dan moluska) meliputi perkembangan masing-masing stadia dan faktor-faktor lingkungan yang memengaruhinya; mortalitas, dinamika cohort dan teori rekruitmen; pertumbuhan larva akuatik; habitat esensial bagi larva akuatik dan peran penting studi larva akuatik dalam konservasi dan pengelolaan sumber daya perikanan

Mata kuliah ini membahas mengenai hewan mamalia dan herpetofauna akuatik yang saat ini menghadapi ancaman langsung akibat eksploitasi/perburuan dan degradasi habitat yang berkombiunasi dengan fenomena iklim global, dan upaya-upaya perlindungannya melalui pengelolaan yang didukung kebijakan dan tatakelola yang tepat.

Ilmu multidisiplin yang mengkaji nasib dan efek merusak dari toksikan lama dan baru yang terpapar di dalam populasi
dan ekosistem perairan. Pengembangan biomarker sebagai indikator dari efek toksikan dalam tubuh organisme

Pengertian habitat dan  eko-biologi mamalia, herpetologi  dan amfibi  (makanan, pertumbuhan, reproduksi, daur hidup, distribusi, migrasi), serta status biota tersebut.

Mata kuliah ini memberikan pengertian tentang model dan simulasi serta perannya dalam perikanan.  Berikutnya dikaji model-model utama yang ada dalam perikanan dan perairan beserta simulasinya.  Ada dua model yang akan dibahas dalam mata kuliah ini, yaitu simple model equations dan multicomponent system model.  Simple model equations yang dikaji mencakup model pertumbuhan eksponensial, model pertumbuhan Von Bertalanffy, model yield per recruit Beverton and Holt, model surplus produksi (Shcaefer dan Fox model).  Model multicomponent yang dibahas mencakup The Lotka-Volterra predation model, fishery bionomic model, temperature variation in aquatic systems model.

Studi genetika populasi dan genetika molekuler mempelajari karakterisasi sumberdaya akuatik pada tingkat variasi genetik dan memperhitungkan variasi genetik di dalam dan antar populasi melalui pendekatan frekuensi gen dan kekuatan yang mempengaruhi frekuensi gen, meliputi migrasi, mutasi, seleksi dan pergeseran genetik. Studi pendekatan genetika populasi dalam pengelolaan sumberdaya perikanan, terutama dalam menentukan status populasi atau stok sumberdaya perikanan.