"Program Studi Magister Mikrobiologi (PS S2 MIK) Departemen Biologi FMIPA Institut Pertanian Bogor, diselenggarakan mulai tahun 2007. Pada tahun 1993-2007 penyelenggaraan PS S2 MIK tergabung dalam PS Biologi, Departemen Biologi, FMIPA, IPB. Tahun 2007 melalui SK Rektor No 027/K13/PP/2007 menjadi PS S2 MIK di departemen Biologi. PS S2 MIK merupakan satu-satunya Program Magister Mikrobiologi di Indonesia. PS S2 MIK didirikan sebagai antisipasi terhadap kebutuhan masyarakat dan perkembangan ilmu. Kesadaran masyarakat ilmiah akan bergantungnya kehidupan makroorganisme terhadap mikroorganisme memunculkan peran mikroorganisme lebih ke depan. Ketersediaan Sumber Daya Manusia dan dukungan infrastruktur yang memadai mendorong PS S2 MIK untuk meningkatkan penemuan ilmu dan teknologi berbasis mikroba tropika dan dikembangkan sampai ke dalam aspek komersialisasi yang berkelanjutan berdasarkan prinsip-prinsip konservasi dan keamanan hayati untuk menjaga kualitas kehidupan. "
adalah menjadi pusat unggulan dalam pendidikan pascasarjana Program Magister (S2) Mikrobiologi tropika yang unggul dalam penelitian, pengembangan mikrobiologi tropika dalam bidang ilmu dasar, biodiversitas dan bioteknologi, untuk pembangunan agribisnis dan bioindustri yang ramah lingkungan
"1.Bidang pendidikan. Menghasilkan magister dalam bidang mikrobiologi yang berkualitas tinggi dan mampu berperan dalam pengembangan ilmu pengetahuan dan teknologi serta berperan aktif dalam pembangunan nasional. 2. Bidang penelitian. Mengembangkan pengetahuan dasar mikrobiologi sebagai landasan dalam pengelolaan keanekaragaman mikroorganisme dan penerapan bioteknologi yang menunjang bidang pertanian, industri, kesehatan, dan lingkungan. 3. Bidang pengabdian. Berperan dalam pembangunan pertanian, industri yang berdasarkan pada pengelolaan dan pemanfaatan sumberdaya alam sebesar-besarnya secara berkelanjutan untuk kesejahteraan bangsa Indonesia khususnya dan kehidupan umumnya. "
1. Mampu berpikir logis dan sistematis untuk analisis dan sintesis serta komunikasinya dalam menyiapkan, menangani, mengelola, dan menyajikan beberapa alternatif solusi terhadap permasalahan di bidang mikrobiologi pertanian tropika, kesehatan,bioindustri, serta pengelolaan biodiversitas dan lingkungan. 2. Mengembangkan pengetahuan mikrobiologi dan aplikasinya dalam bidang pertanian tropika, kesehatan, lingkungan, biodiversitas, bioindustri melalui riset hingga menghasil-kan karya inovatif dan teruji. 3. Mampu mengelola riset pada bidang mikrobiologi secara mandiri dan dapat diberi tanggung jawab atas pencapaian hasil kerjanya dengan mengutamakan keselamatan dan keamanan, serta mampu secara efektif mengkomunikasikan ide-ide dan hasil kerjanya dalam berbagai bentuk media yang sesuai keperluannya. "
"mengembangkan ilmu pengetahuan dan teknologi dasar di bidang biologi yang mendasari pengelolaan dan pengembangan keanekaragaman hayati dan lingkungan"
Mata Kuliah ini mendiskusikan keragaman fisiologi dan produksi metabolit oleh mikrob. Produk-produk metabolit mikrob yang unik, penting dan bernilai ekonomi juga akan dibahas beserta dengan potensi rekayasanya dalam rangka pengembangan fenotipe baru untuk bidang bioteknologi, industri dan lingkungan. Teknik-teknik modern berbasis big data dan bioinformatics dalam menganalisis metabolit juga akan didiskusikan. Diskusi aktif mahasiswa baik secara individu maupun kelompok. akan menjadi bagian utama dalam penyelenggaran perkuliahan.
Mata kuliah ini membahas mengenai kimia DNA dan struktur organisasi genom prokaryot, genetika plasmid, serta transfer gen pada prokariot khususnya menggunakan bakteri sebagai model yang meliputi konjugasi, transformasi dan transduksi. Disamping itu juga membahas elemen genetik yang dapat bergerak/meloncat, ekspresi gen dan regulasinya pada prokaryot, serta teknologi DNA rekombinan/kloning gen, dan produksi protein rekombinan di prokaryot dan eukaryot juga dibahas. Selanjutnya, bioteknologi mikrob yang berkelanjutan/ramah lingkungan serta etika dalam bioteknologi dan paten juga didiskusikan. Genetika fungi dan bioteknologinya khususnya terkait dengan kloning gen dari fungi dan rekayasa genetikanya juga akan dibahas dalam mata kuliah ini.
Pembahasan mencakup pengetahuan dan teknologi terkait mikrob dan lingkungannya yang mencakup overview tentang konsep dasar kehidupan dan diversitas mikrob di lingkungan, mikrob terestrial, aeromikrobiologi, mikrob di lingkungan akuatik dan ekstrim, transport mikrob di alam, teknik untuk mengkaji mikorb di alam, siklus biogeokimia, aspek bioteknologi lingkungan berbasis mikrob dan pengetahuan terkini tentang mikrob dan lingkungannya. Pendalaman materi dilakukan melalui diskusi interaktif dan tugas terstruktur terkait peran mikrob untuk lingkungan berkelanjutan.
Mata kuliah Diversitas dan Sistematika Mikrob membahas keanekaragaman mikrob eukaryota (cendawan) dan prokaryota (bakteri) melalui berbagai pendekatan dalam prinsip-prinsip membangun takson dan menyusunnya dalam sistem hirarki yang mengacu pada peraturan dan rekomendasi tatanama bakteri dan cendawan.
Matakuliah mencakup penjelasan dan praktik tentang teknik-teknik isolasi cendawan dari berbagai substrat dan karakterisasi isolat secara morfologi, ekologi, fisiologi, genetika, dan biosistematika. Dengan cakupan materi praktikumnya meliputi mengenal cendawan melalui pengamatan mikroskopi morfologi struktur somatik dan reproduksinya serta penggunaan kunci identifikasi; menganalisis keragaman cendawan berdasarkan keragaman spesies dalam habitat yang sama untuk memahami ekologi cendawan; memahami fisiologi cendawan dengan membuat panganan tradisionil di lokasi saudara dengan menggunakan fermentasi yang tidak disengaja atau melalui back slopping; memahami biosistematika dengan cara analisis sekuen DNA sebagai bagian dari bioinformatika sederhana
Kuliah ini mempelajari ciri-ciri dan kemampuan mikrob yang memungkinkannya mempunyai potensi yang luar biasa yang dapat dimanfaatkan, seperti untuk proses fermentasi, biokonversi, penghasil enzim hidrolitik, antibiotik, protein sel tnggal, dalam rangka mendukung ketercapaian sustainable development goals. Kuliah ini dilengkapi praktikum untuk menggali potensi mikrob berbasis proyek, studi kasus, dan problem based learning.
Cakupan materi meliputi biologi interaksi antara mikrob dan inang baik pada tumbuhan maupun hewan dan manusia yang meliputi interaksi mutualistik, netral, dan parasitik. Materi yang diberikan meliputi biodiversitas, ekologi, fisiologi, mekanisme interaksi dan peranannya dalam bidang pertanian, kesehatan, dan lingkungan. Diskusi aktif mahasiswa baik secara individu maupun kelompok akan menjadi bagian utama dalam penyelenggaran perkuliahan.
Mata kuliah Bioteknologi Senyawa Antimikrob menyajikan tentang skrining senyawa antimikrob yang mencakup senyawa antimikrob dari organisme, dari mikroorganisme, senyawa semisintetik dan senyawa bakteriosin serta bakteriofage sebagai solusi senyawa antimikrob yang resisten. Dijelaskan strategi seleksi dan skrining untuk mendapatkan senyawa antimikrob tersebut baik secara konvensional maupun secara virtual melalui teknik siliko dan doking. Dijelaskan pengetahuan pendukung yaitu fisiologi produksi, mekanisme kerja, biosintesis, resistensi, metode uji aktivitas, ektraksi dan purifikasi berdasarkan teknik mikrobiologi (bioautografi), teknik kimia (kromatografi) dan fisikokimia sehingga diperoleh senyawa antimikrob murni yang selanjutnya dapat dikarakterisasi dan ditentukanstruktur molekulnya.
Seminar rencana penelitian mahasiswa magister yang dilakukan sebagai wadah forum diskusi agar penelitian dapat berjalan dengan baik
Mata kuliah Proposal penelitian ini menuntut mahasiswa menuliskan proposal rencana penelitiannya, yang dilengkapi dengan tinjauan pustaka
Mata kuliah ini berisi praktikum yang terbagi dalam 2 tema yaitu fisiologi dan genetika prokariot. Mahasiswa akan diminta menyelesaikan suatu proyek secara mandiri. Laporan dapat berupa laporan tertulis dan atau presentasi hasil.
Mata kuliah ini dalam bentuk proyek dengan dua topik besar yaitu “Biologi cendawan” dan “Produk-produk penting dari cendawan”. Biologi cendawan meliputi cendawan pada makanan tradisional; jamur pangan dan obat; mikoriza; liken; patogen tanaman, gulma, serangga dan nematoda dan jamur pelapuk lignoselulosa. Produk-produk penting dari cendawan meliputi produk hasil dekomposisi dan metabolismenya yaitu metabolit primer dan sekunder yang bermanfaat di bidang pertanian, industri, lingkungan dan energi
Mata kuliah ini ditujukan untuk memberikan landasan tentang statistika yang meliputi metode pengumpulan data, pemodelan dan analisis data, prinsip pendugaan parameter dan pengujian hipotesis satu populasi serta dua populasi. Untuk pengumpulan data ditekankan pada metode percobaan (experiment) dan metode percontohan (sampling), sedangkan untuk analisis ditekankan pada analisis regresi (regresi linear dan regresi logistik), analisis ragam dan pembandingan ganda (multiple comparison) dan tabel kontingensi. Dalam analisis juga dibahas tentang penyimpangan
dari asumsi model linear, baik menyangkut akibat pelanggaran asumsi maupun bagaimana cara
mengatasinya. Metode pembelajaran ditekankan pada learning from data yang diintegrasikan
dengan penggunaan program kemasan statistika (statistical package program).
Merupakan tugas akhir mahasiswa program magister di Departemen Biologi sebagai salah satu syarat kelulusan yang meliputi kegiatan penelitian di dalam laboratorium maupun di lapangan, dan penulisan tesis
Ujian tesis atau ujian akhir program magister merupakan evaluasi tahap akhir setelah mahasiswa program magister melakukan kegiatan penelitian, penulisan tesis, dan seminar. Ujian tesis ini dimaksudkan untuk menilai kemampuan mahasiswa program magister dalam mempertahankan materi yang terdapat dalam tesis dan merupakan uji kualifikasi/kemampuan penentu untuk memperoleh gelar. Lingkup ujian tesis meliputi draft tesis dan pengetahuan komprehensif mahasiswa yang berkaitan dengan kompetensi [keilmuan dan metodologi], berfikir [analisis, sintesis], komunikasi dan solusi yang berkaitan langsung dan tidak langsung dengan tesis. Mahasiswa program magister yang akan melakukan ujian akhir harus harus memenuhi persyaratan akademis maupun administrasi yang telah ditetapkan SPs-IPB
Publikasi ilmiah nasional adalah publikasi yang ditujukan untuk mempublikasikan hasil penelitian atau karya ilmiah di tingkat nasional. Publikasi ilmiah nasional termasuk Prosiding Seminar (International), publikasi yang berisi kumpulan makalah atau artikel hasil presentasi di seminar (International, terindex Scopus). Prosiding seminar (Internmational) sering kali diterbitkan dalam bentuk buku atau jurnal untuk menyebarluaskan hasil penelitian yang disajikan di seminar tersebut.
Publikasi ilmiah internasional ditujukan untuk penyebarluasan hasil penelitian ilmiah orisinal dari bagian disertasi tugas akhir mahasiswa program doktor untuk memberikan informasi kepada kalangan akademisi atau para ahli di bidangnya. Publikasi dilakukan pada berkala ilmiah internasional bereputasi atau terindeks global.